HOOMD — различия между версиями

Материал из ЭНЭ
Перейти к: навигация, поиск
м (Источники)
м
 
Строка 4: Строка 4:
  
 
Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды [[CUDA]], т. е., на параллелизацию расчёта.
 
Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды [[CUDA]], т. е., на параллелизацию расчёта.
 +
 +
''Сведения по состоянию на 2-й квартал 2012 года''.
  
 
— [[user:Yury Tarasievich|Ю.Т.]]
 
— [[user:Yury Tarasievich|Ю.Т.]]

Текущая версия на 11:17, 17 августа 2015

HOOMD-blue (Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics): пакет ОТ для моделирования динамики частиц в преимущественно небиологических материалах (атомные системы, полимеры). Пакет является прямым развитием пакета HOOMD и разрабатывается в Университете штата Мичиган; пакет HOOMD разработан некогда в Лаборатории Эймс (Ames Lab) и Университете штата Айова.

В числе включённых методик: парные потенциалы (CGCMM, гауссов, Леннарда-Джонса, Морзе, Юкавы и др.), потенциалы связей (FENE, гармонический), угловые потенциалы (гармонический, CGCMM), дигедральные/неправильные потенциалы; интеграторы (броуновской динамики (NVT), NPT, NVE, NVT); минимизация энергии (FIRE).

Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды CUDA, т. е., на параллелизацию расчёта.

Сведения по состоянию на 2-й квартал 2012 года.

Ю.Т.

Источники

  • Сайт проекта: [1].
  • Открытое ПО лаборатории Эймс: [2].