HOOMD — различия между версиями
(Новая страница: «'''HOOMD-blue''' (''Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics''): пакет ОТ для моделирования динамики части…») |
м |
||
| (не показана одна промежуточная версия этого же участника) | |||
| Строка 4: | Строка 4: | ||
Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды [[CUDA]], т. е., на параллелизацию расчёта. | Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды [[CUDA]], т. е., на параллелизацию расчёта. | ||
| + | |||
| + | ''Сведения по состоянию на 2-й квартал 2012 года''. | ||
— [[user:Yury Tarasievich|Ю.Т.]] | — [[user:Yury Tarasievich|Ю.Т.]] | ||
== Источники == | == Источники == | ||
* Сайт проекта: [http://codeblue.umich.edu/hoomd-blue/]. | * Сайт проекта: [http://codeblue.umich.edu/hoomd-blue/]. | ||
| − | * Открытое ПО | + | * Открытое ПО лаборатории Эймс: [http://ameslab.gov/open-source-software]. |
[[category:ПО квантомеханических и молекулярных расчётов]] | [[category:ПО квантомеханических и молекулярных расчётов]] | ||
Текущая версия на 11:17, 17 августа 2015
HOOMD-blue (Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics): пакет ОТ для моделирования динамики частиц в преимущественно небиологических материалах (атомные системы, полимеры). Пакет является прямым развитием пакета HOOMD и разрабатывается в Университете штата Мичиган; пакет HOOMD разработан некогда в Лаборатории Эймс (Ames Lab) и Университете штата Айова.
В числе включённых методик: парные потенциалы (CGCMM, гауссов, Леннарда-Джонса, Морзе, Юкавы и др.), потенциалы связей (FENE, гармонический), угловые потенциалы (гармонический, CGCMM), дигедральные/неправильные потенциалы; интеграторы (броуновской динамики (NVT), NPT, NVE, NVT); минимизация энергии (FIRE).
Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды CUDA, т. е., на параллелизацию расчёта.
Сведения по состоянию на 2-й квартал 2012 года.
— Ю.Т.
