HOOMD — различия между версиями

Материал из ЭНЭ
Перейти к: навигация, поиск
(Новая страница: «'''HOOMD-blue''' (''Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics''): пакет ОТ для моделирования динамики части…»)
 
м (Источники)
Строка 8: Строка 8:
 
== Источники ==
 
== Источники ==
 
* Сайт проекта: [http://codeblue.umich.edu/hoomd-blue/].
 
* Сайт проекта: [http://codeblue.umich.edu/hoomd-blue/].
* Открытое ПО Лаборатории Эймс: [http//ameslab.gov/open-source-software].
+
* Открытое ПО лаборатории Эймс: [http://ameslab.gov/open-source-software].
  
 
[[category:ПО квантомеханических и молекулярных расчётов]]
 
[[category:ПО квантомеханических и молекулярных расчётов]]

Версия 10:08, 17 августа 2015

HOOMD-blue (Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics): пакет ОТ для моделирования динамики частиц в преимущественно небиологических материалах (атомные системы, полимеры). Пакет является прямым развитием пакета HOOMD и разрабатывается в Университете штата Мичиган; пакет HOOMD разработан некогда в Лаборатории Эймс (Ames Lab) и Университете штата Айова.

В числе включённых методик: парные потенциалы (CGCMM, гауссов, Леннарда-Джонса, Морзе, Юкавы и др.), потенциалы связей (FENE, гармонический), угловые потенциалы (гармонический, CGCMM), дигедральные/неправильные потенциалы; интеграторы (броуновской динамики (NVT), NPT, NVE, NVT); минимизация энергии (FIRE).

Языки программирования Си++ и Питон. Форматы данных XML, MOL2, DCD, PDB. Пакет оптимизирован по скорости и рассчитан на возможное использование среды CUDA, т. е., на параллелизацию расчёта.

Ю.Т.

Источники

  • Сайт проекта: [1].
  • Открытое ПО лаборатории Эймс: [2].